Inovatívne technológie a tradičné hodnoty v službách pacientov
S Tomášom Laluhom z farmaceutickej spoločnosti Takeda sme sa rozprávali o tom, ako sa spájajú odborné znalosti a inovácie s osobným odhodlaním zlepšovať životy tých, ktorí to najviac potrebujú.
Kategórie: Veda v médiách
V piatok nastane zatmenie Mesiaca. Zo Slovenska bude pozorovateľné ako polotieňové
Úplné zatmenie Mesiaca bude viditeľné v zahraničí.
Kategórie: Veda v médiách
Sieť X sa stala terčom kybernetického útoku a Musk z neho obvinil Ukrajinu. Prihlásil sa však iný vinník
K útoku sa prihlásila propalestínska skupina.
Kategórie: Veda v médiách
Najstarší kráter na Zemi mení pohľad na dejiny planéty
Vedci v Austrálii objavili najstarší známy dopadový kráter starý 3,5 miliardy rokov. Posúvajú tým hranice poznania o možnom vzniku života na našej planéte.
Kategórie: Veda v médiách
Znovu sa rozprávame o užitočnosti očkovania?
(Ne)vedecký newsletter Tomáša Prokopčáka.
Kategórie: Veda v médiách
Ďalší skúšobný let Muskovej kozmickej lode sa skončil neúspechom. Starship explodovala, narušila leteckú dopravu
Nosná raketa Super Heavy sa však po oddelení od vesmírnej lode úspešne vrátila na štartovaciu rampu.
Kategórie: Veda v médiách
Neúspech z minulého testu sa zopakoval. Nosná raketa sa vrátila, ale SpaceX opäť prišla o loď
Išlo o v poradí ôsmy let lode Starship.
Kategórie: Veda v médiách
Na Mesiaci pristál americký modul Athena, úspešnosť manévra zisťujú
Modul Athena vyvinula americká spoločnosť Intuitive Machines.
Kategórie: Veda v médiách
Koniec závislosti na Muskovom SpaceX? Európska raketa Ariane 6 odpálila komerčnú éru vesmírnych letov, úspešne odštartovala
ESA už vlani v lete informovala, že má objednávky na desiatky letov s touto raketou.
Kategórie: Veda v médiách
Jozef Murgaš: Moje vynálezy? Na slovenskej dedine by ma považovali za čarodejníka
Rozhovor s vizionárom z 19. storočia pomocou umelej inteligencie.
Kategórie: Veda v médiách
Najväčší a najstarší ľadovec na svete uviazol v južnom Atlantiku
Masa ľadu sa rozpadne na menšie ľadovce, ktoré sa nakoniec roztopia.
Kategórie: Veda v médiách
Rosetta@home Update
First, we’d like to thank all our contributors who have supported and continue to contribute to our scientific projects through Rosetta@home. We want to update you on the status of Rosetta@home projects and our future plans.
With the advancement of AI models like AlphaFold and RosettaFold for protein structure predictions, Rosetta@home has been less used for this purpose. However, researchers are now utilizing Rosetta@home for small molecule and peptide designs, where even the current state-of-the-art AI models struggle due to limitations in generalizability to novel small molecules and non-canonical peptides.
Recently, we have developed a virtual screening protocol in Rosetta, named RosettaVS, for small molecule drug discovery. This work has been published in Nature Communications (https://doi.org/10.1038/s41467-024-52061-7), demonstrating that RosettaVS is one of the best physics-based virtual screening protocols. Combined with deep learning techniques, it can effectively screen multi-billion compound libraries and discover novel compounds for pharmaceutical targets.
While deep learning models like AlphaFold and RosettaFold can predict canonical peptide structures, they cannot handle peptides with non-canonical amino acids or mixed chirality. The physics-based force field in Rosetta has specialized terms to simulate these amino acids. Rosetta will be used to sample hundreds of thousands of different conformations of the designed peptide to validate the structure.
Looking ahead, Rosetta@home will be an invaluable platform for large-scale virtual screening and peptide simulations for drug discovery. We plan to launch more virtual screening jobs and peptide simulations on Rosetta@home in the near future.
Thank you!
With the advancement of AI models like AlphaFold and RosettaFold for protein structure predictions, Rosetta@home has been less used for this purpose. However, researchers are now utilizing Rosetta@home for small molecule and peptide designs, where even the current state-of-the-art AI models struggle due to limitations in generalizability to novel small molecules and non-canonical peptides.
Recently, we have developed a virtual screening protocol in Rosetta, named RosettaVS, for small molecule drug discovery. This work has been published in Nature Communications (https://doi.org/10.1038/s41467-024-52061-7), demonstrating that RosettaVS is one of the best physics-based virtual screening protocols. Combined with deep learning techniques, it can effectively screen multi-billion compound libraries and discover novel compounds for pharmaceutical targets.
While deep learning models like AlphaFold and RosettaFold can predict canonical peptide structures, they cannot handle peptides with non-canonical amino acids or mixed chirality. The physics-based force field in Rosetta has specialized terms to simulate these amino acids. Rosetta will be used to sample hundreds of thousands of different conformations of the designed peptide to validate the structure.
Looking ahead, Rosetta@home will be an invaluable platform for large-scale virtual screening and peptide simulations for drug discovery. We plan to launch more virtual screening jobs and peptide simulations on Rosetta@home in the near future.
Thank you!
Kategórie: Novinky z projektov
Štart novej európskej rakety odložili len 30 minút pred plánovaným odletom
Francúzske vojenské družice doteraz nikdy neboli vyslané do takejto riskantnej operácie.
Kategórie: Veda v médiách
Na Mesiaci pristál modul Blue Ghost, na Zem poslal už prvé snímky
Modul bude zbierať vzorky pre NASA.
Kategórie: Veda v médiách
Na Mesiaci pristál modul Blue Ghost americkej spoločnosti Firefly Aerospace
Stroj bude zbierať vzorky mesačného prachu, merať teplotu pod povrchom a vykonávať ďalšie experimenty pre NASA.
Kategórie: Veda v médiách
Vesmírna stanica je príliš sterilná. Astronauti potrebujú viac mikróbov zo Zeme, tvrdia vedci
Nová štúdia naznačuje, že jej sterilné prostredie môže negatívne ovplyvňovať zdravie astronautov, ktorí trpia oslabenou imunitou, oparmi či vyrážkami.
Kategórie: Veda v médiách
Železná doba mohla odštartovať úplne inde
(Ne)vedecký newsletter Tomáša Prokopčáka.
Kategórie: Veda v médiách
Významné nálezy egyptológov aj elastický model DNA. Čo sa deje v slovenskej vede (prehľad)
Čo je nové vo vede na Slovensku.
Kategórie: Veda v médiách
V Austrálii vyrobia najväčší vodíkový katamarán. Bude to trajekt, objednali si ho Švédi
V skutočnosti ide o trajekt, ktorý bude plne pripravený využívať vodík, kým však preň nebude zabezpečená vodíková infraštruktúra, bude využívať CNG. Medzi oboma pohonmi možno prepínať.
Kategórie: Veda v médiách
Ocenený onkológ: Pacient, ktorý nedôveruje medicíne, väčšinou k lekárovi ani nejde
Michal Mego dostal v rámci ESET Science Award 2024 cenu verejnosti.
Kategórie: Veda v médiách