Domov » Články

Všetky články

Všetky články, ktoré boli napísané a publikované

Stručný sprievodca k projektu Rosetta a jeho grafike

Článok — napísal: Duro Kotulic Bunta, 28. apríl 2009
Kategórie:
Projekt:

Jedným z hlavných cieľov projektu Rosetta je predpovedať tvar proteínov, ktoré sa vyskytujú v prírode. Proteíny (bielkoviny) sú veľké molekuly zložené z malých stavebných blokov - aminokyselín, a častokrát sú nazývané "reťazce". Aminokyseliny sa dajú predstaviť ako ohnivká v tejto reťazi/reťazci. Pre lepšie pochopenie si uveďme nasledujúcu analógiu. Ak si predstavíme obyčajnú železnú reťaz, tak tá môže mať veľké množstvo rôznych tvarov závisiac od síl, ktoré na ňu budú pôsobiť. Ak napríklad reťaz potiahnete, narovná sa do priamej línie, a keď ju hodíte na zem, nadobudne vždy jedinečný tvar. Na rozdiel od železnej reťaze, ktorú tvoria identické železné ohnivká, proteíny sú tvorené dvadsiatimi rôznymi aminokyselinami, z ktorých každá má svoje osobitné vlastnosti (napr. rôzny tvar, či príťažlivé a odpudivé sily), ktoré dohromady vytvárajú sily, ktoré primäjú proteín k tomu, aby nadobudol jedinečný a špecifický tvar. Tento tvar je daný poradím, v akom sú zoradené jednotlivé aminokyseliny v proteíne. V prírode existuje veľké množstvo proteínov s veľmi rôznym počtom aminokyselín a ich zoradením.

0
Your rating: None

Rosetta prezentuje minuloročné výsledky

Článok — napísal: miloso, 11. marec 2009
Kategórie:
Projekt:

Šéf projektu, David Baker stručne prezentoval na diskusnom fóre najnovšie výsledky projektu Rosetta@home. Profesor Baker pracuje na siedmych rukopisoch, kde budú podrobne popísané závery najnovšieho výskumu a na fóre zverejnil ich krátke popisy.
 

3.666665
Your rating: None Average: 3.7 (6 votes)

SETI postúpilo o krôčik ďalej - presunulo sa na GPU

Článok — napísal: Devaster, 28. február 2009
Kategórie:
Projekt:

V poslednej dobe je na SETI fórach veľký ruch okolo aplikácie pracujúcej na GPU od firmy NVIDIA. Táto aplikácia aj napriek minimalnej optimalizácií vykazuje viac ako dvojnásobný výkon pri použití už teraz viacmenej low-endovej GPU 9600GT oproti v8 optimalizovanej CPU verzie na AMD Phenom (moje osobné merania). Prečo začali byť grafické karty v centre záujmu vývojárov?

3.6
Your rating: None Average: 3.6 (5 votes)

Rosetta@home - Grafické rozhranie

Článok — napísal: miloso, 13. február 2009
Kategórie:
Projekt:

Hlavným cieľom Rosetty je predpovedať tvary, ktoré bielkoviny zaujmú v prírode. Tento proces si môžeme prestaviť ako ohýbanie „reťaze“, kde jednotlivé oká predstavujú jednotlivé aminokyseliny. Každá aminokyselina má unikátne vlastnosti (rôzne príťažlivé a odpudivé sily). Na základe týchto síl je možné vypočítať energetický obsah každého ohybu, bielkoviny, teda nájsť energeticky výhodný tvar.
 

4.8
Your rating: None Average: 4.8 (5 votes)

Inštalácia optimalizovanej aplikácie

Článok — napísal: Palo M., 9. február 2009
Kategórie:

 Tento článok je len výhonok. Bol pridaný hlavne na testovanie Views v sekcii "Stiahnite si".

0
Your rating: None
  • Ak chcete pridať komentáre, tak sa musíte prihlásiť
  • prečítané 10035x

Rosetta@home - Tajomstvo bielkovín

Článok — napísal: miloso, 28. január 2009
Kategórie:
Projekt:

Bielkoviny, jeden zo štyroch základných bioelementov bunky, bielkoviny, nukleové kyseliny, sacharidy a tuky. Bielkoviny plnia v organizme mnohoraké úlohy a to vďaka premyslenému systému kódovania, z ktorého vyplýva, že existuje množstvo bielkovín skladajúcich sa z 20 aminokyselín a odlišujúcich sa primárnou, sekundárnou, terciárnou a kvartérnou štruktúrou. To má za následok mnohoraké funkcie. Pochopeniu funkcii vyplývajúcich z štruktúry nám pomôže poodhaliť, okrem iného, príčiny a spôsoby liečby niektorých ochorení.

0
Your rating: None

Pripojte sa do BOINC v Ubuntu

Článok — napísal: gabberattack, 27. január 2009
Kategórie:

Mnoho ľudí si myslí, že práca s Linuxom vyžaduje špecifické znalosti. Nie vždy je tomu tak a najnovšie distribúcie dokazujú, že ovládanie systému môže byť čisto odklikávacia záležitosť. Rovnako je to aj s inštaláciou BOINC, ktorá nie je problematická. Nasledujúci návod je vytvorený pre začiatočníkov s Linuxom a zobrazuje inštaláciu na distribúcii Ubuntu (otestované na verzii 8.04 a 8.10).

4.6
Your rating: None Average: 4.6 (5 votes)

Prezentácia projektov BOINC

Článok — napísal: Palo M., 27. január 2009
Kategórie:

 Za jej vytvorenie ďakujeme Martinovi Suchanovi a Jurajovi Kotuličovi Buntovi.

3.875
Your rating: None Average: 3.9 (8 votes)

Návod na prispievanie na web

Článok — napísal: Palo M., 20. december 2008
Kategórie:

imageWeb beží na redakčnom systéme Drupal, ktorý je veľmi flexibilný. Funkčnosť tejto inštalácie bola rozšírená viacerými modulmi, ktoré dopĺňajú základné funkcie Drupalu. Z dôvodu bezpečnosti, stability a zjednodušenia prispievania bol systém nastavený určitým spôsobom, ktorý umožňuje súčasné prispievanie viacerých členov a tým spoločné budovanie webu. Tento návod bol vypracovaný pre členov komunity na ľahšiu orientáciu pri prispievaní na web. 

4.666665
Your rating: None Average: 4.7 (6 votes)

História distribuovaných výpočtov

Článok — napísal: Palo M., 1. november 2008
Kategórie:

imageBOINC je len jedným z mnohých systémov pre distribuované výpočty. Aké ďalšie systémy existujú? Kedy začali vznikať? Ako sa vyvíjali? Čo majú spoločné a čím sa líšia? Kam smeruje ďalší vývoj?

Aj o týchto témach pojednáva nasledujúci článok.

2
Your rating: None Average: 2 (6 votes)